Serveis
MARGenomics ofereix un ampli catàleg de serveis integrant totes les fases d’un procés d’anàlisi genòmica, des de la fase inicial d’assessorament al projecte, fins l’anàlisi final de les dades, la validació dels resultats i el suport expert en la seva interpretació.
La sol·licitud d’aquests serveis es gestiona des d’una secretaria única que dona suport als tràmits de gestió de sol·licituds, a l’elaboració dels documents ètic/legals, als acords de transferència de mostres i/o dades (MTA), i als pressupostos i facturació.
La sol·licitud pot incloure diverses fases de l’anàlisi genòmica però també és possible iniciar una sol·licitud en qualsevol dels punts intermedis de la cadena de serveis que s’ofereixen.
Assessorament en el disseny experimental
Extracció d’ADN i/o ARN en diferents tipus de mostres (sang total, teixit congelat o parafinat, etc.)
Anàlisi de la qualitat de l’ ADN/ARN (Quantificació i Integritat)
- Quantificació de ADN o ARN per fluorimetria i/o espectrofotometria
- Anàlisis de la integritat de l’ADN amb gels d’agarosa i/o Bioanalyzer
- Anàlisis de la integritat de l’ARN per Bioanalyzer
PCR quantitativa en temps real ( qPCR)
Microarrays
- Expressió
- Genòmics
Next Generation sequencing (Preparació de llibreries i processament en les plataformes adequades)
- Whole Genome sequencing
- Exome sequencing
- RNA sequencing
- Small RNA sequencing
- Panel sequencing
- ChIP sequencing
- Bisulfite sequencing
Anàlisi de dades
- Alineament de seqüències
- Variant Calling i anàlisis de Copy Number procedent de dades genòmiques
- Identificació de gens diferencialment expressats, splicing alternatiu i gens de fusió en dades transcriptòmiques
- Estudi de smallRNAs a través de l’anàlisi del microtranscriptoma.
- Identificació de les regions amb pics d’interacció entre proteïna i ADN en experiments de seqüenciació d’immunoprecipitació de cromatina (ChIP-seq)
- Identificació de posicions o regions d’ADN metilades en dades del metiloma
- Integració de dades procedents de diferents plataformes òmiques utilitzant metodologia específica
- Anàlisis de microarrays
- Anàlisis de qPCR